自动化与电气工程学院成立于2000年12月。源于1958年的船舶电气管理专业和控制工程专业，具有40多年的发展历史，电气工程及其自动化专业的船舶电气管理方向学士学位于1979年获得英国轮机工程学会的认可并注册。学院设有五个教研室，一个研究所，一个公司，即：自动控制教研室、船舶电气工程教研室、微机控制教研室、电子技术教研室、有控制理论与控制工程、电力电子与电力传动两个硕士学位授予专业。有"控制工程"工程硕士学位授予权。"控制理论与控制工程"博士点、"检测技术与自动化装置"和"电力系统自动化"两个硕士点正在建设中。学院还参与轮机工程博士点的共建。目前，本科、硕士、博士各类在校生700多人。本科学制四年，今年共招收本科威240名。
本学院师资力量雄厚，教学管理完善，科研开发活跃。全院有教职工72人，其中教授11人，副教授23人。高级工程师4人，高级实验师3人。学院教师结构合理，具有较高的学术水平和教学水平，治学严谨，学术氛围浓厚。近年来，出版各类学术专著5部，在国内外学术刊物上发表研究论文数百篇。与国内外同行建立了广泛的学术交流与联系。
学院大力开展科学研究、技术开发等科研工作，学院每年承担了国家级、省部级科技攻关等科研课题和企业委托的科研课题二十多项，近年来，多次获得省部级科技进步奖。学院重视对学生实践能力和创新能力的培养。2003年在全国大学生"挑战杯"技术竞赛和"电子设计"大赛中均获得很好成绩。
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