比较是人们根据一定的认识和实践目的，把一事物与其他事物的属性和特征加以比较，以确定事物之间的共同点和差异点的思维方法.比较法是初中生物教学中常用的方法。例如，比较植物和动物的共同特点，从中发现生物的共同特征，这是比较法中的求同思维；比较单子叶植物和双子叶植物的叶脉特点，这是求异思维的体现；比较植物细胞和动物细胞，找到其共同点和不同点，这就是比较法中的既求同又求异；一般来说，在相异的对象间探求相同点，在相同的对象间探求相异点，能够更好地认识和把握事物，同时更好地训练学生的求同、求异思维。
比较时需要根据比较对象的特点和教学目的确定比较范围的大小。例如，可进行全面或局部比较，纵向或横向比较，单项比较或多项比较，简单比较和复杂比较。教学时，要明确比较范围，做到重点突出。
分类是根据对象的共同点和差异性，把对象分为不同种类的逻辑思维方法。比较是分类的基础，只有比较对象的共同点和差异性，才能进行科学的分类。分类分为“分”和“类”，“分”的依据是对象的不同点，“类”的依据是对象的相同点，分类体现了客观事物的共性与个性的差异，有助于人们更好地认识客观事物的本质特点。
依据人类对事物的认识是从现象到本质的深入过程，分类可分为现象分类和本质分类。在生物学教学时，学生往往被现象所迷惑，而没有从本质上将对象所分开。例如，学生很容易将蓝藻和绿藻都看成藻类植物，因为学生只看到它们都有“藻”字，但从本质上看，前者是原核生物，后者才是真核生物中的藻类植物。动物类群的教学中更是如此，从现象（表面的形态上看）是同一种生物，但从本质看又是不同的生物。例如，鲸看起来像鱼，但本质上是哺乳动物；蝙蝠看起来像鸟，但本质上是哺乳动物；泥鳅看起来像爬行动物，但本质上是鱼类。
比较和分类这两种科学方法在初中生物学教学中广泛用到，掌握这两种科学方法，对于生物现象及其本质的理解是非常有帮助的。
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