“科学研究的目的，归根结底就是为了服务社会。”马洪雨说。因此，除了泡在实验室做实验和到图书室查阅大量文献之外，他经常现身生产一线，跟渔民打交道，了解养殖的现实状况，亲自到水产养殖基地进行育苗养殖管理。刚开始面临人手不够的状况，他就和渔民一起下海进行捕捞，经常除了吃饭和睡觉，就是工作连轴转，风里来雨里去的日子已经司空见惯，可以说条件相当艰苦。

马洪雨的主要研究对象是青蟹。青蟹属梭子蟹科，盛产于温暖的浅海中，主要分布在中国浙江、广东、广西、福建和台湾等沿海区域。因为它具有非常高的营养价值，因此成为人们餐桌上的“宠儿”。正是得益于人们对青蟹的喜爱，因此产品需求量也迅速上升。但是面对不断攀升的市场需求，如果按照传统的养殖方式来生产，只能是面临供不应求的局面。那么想要从根源上解决青蟹的供需问题，首要的方法就是提高生产效率。马洪雨切入的角度就是开展青蟹的选育工作。顾名思义，选育主要包括两个重要的关键词，筛选和培育。比如在实验开始前，要从所有蟹群中筛选出不同来源的亲蟹，然后从中优选出活力强、身体特征正常，体重较大的作为备选亲蟹，待雌蟹交配后分别养于不同促熟池中;然后结合青蟹生长的蚤状幼期、仔蟹标粗期、商品蟹期及成熟期等不同阶段进行再次筛选和培育。通过这种对青蟹多代的阶段式群体选育，最终优选出高产、稳产、优质的适合我国养殖环境的青蟹新品种。有了这些优质品种的保证，就可以以此为基础引入到不同的苗种场展开大规模养殖的工作。

围绕新品种选育、基因组等方面的研究只是马洪雨诸多研究内容中的一项，多年来，他在科研履历表中交上了硕果累累的成绩单。比如他在海洋鱼、蟹线粒体基因组挖掘、系统进化和种群遗传学方面取得了一系列研究进展;通过高通量测序揭示了拟穴青蟹转录组结构与特征，大规模开发了功能基因和分子标记;鉴定出规模化的与生长发育、机体免疫相关的功能基因，阐明了近10个重要基因在拟穴青蟹不同发育时期和不同组织器官中的时空表达特性;首次发现了拟穴青蟹的印记基因，并查明了其印记表达特征。系统评估了拟穴青蟹种质资源特性，为保护、恢复和合理开发利用这一重要资源提供了理论依据;建立了拟穴青蟹分子标记辅助育种技术和人工选择育种技术，培育出生长快速的新品系1个等等。

基于以上令人艳羡的成绩，马洪雨当然也获誉颇多。近年来，他一共承担科研项目近20项，其中主持国家自然科学基金、国家留学人员科技活动项目择优资助重点项目、上海市自然科学基金、上海市“科技创新行动计划”科技支撑项目、国家“973”项目子课题、中央级科研院所基本科研业务费重点项目等课题10项;发表论文77篇，SCI收录56篇，出版专著3部;获得国家发明专利授权11项、实用新型专利授权10项、软件著作权1项;荣获上海市科技进步奖二等奖、中国水产科学研究院科技进步奖二等奖、上海海洋科学技术奖二等奖、中华农业科技奖一等奖等科技奖励10余项;入选国家“万人计划”中组部青年拔尖人才计划、荣获第十三届“上海市青年岗位能手”荣誉称号;入选中国水产科学研究院“百人培育计划”。

虽然马洪雨的成绩，领导和同事们都有目共睹，但是他非常谦虚地表示：“科研工作的成果绝非一个人的功劳，而是整个团队协作的结晶，只有大家互相配合分工，团队成员之间相互包容、理解，才能把工作做好。”对于团队里每位成员的贡献，他也表示由衷的感激。对于目前在进行的研究，他希望先把新品种选育工作做好，未来也将通过新品种推广和示范，提高中国青蟹养殖产业的水平。

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