用纤维素酶和果胶酶去掉植物细胞壁后得到的就是一团原生质体。
成熟植物细胞内由细胞膜、液泡膜及两者之间的细胞质构成的是原生质层。只在成熟植物细胞才有，动物及细菌细胞无此结构。部分学生常把去掉植物细胞壁后剩下的部分答成“原生质层”。
2半透膜与选择透过性膜
半透膜指某些小分子物质可以透过，而大分子物质不能透过的多孔性薄膜。半透膜是没有生命活性的，如赛璐玢（俗称玻璃纸）。有些生物膜死亡后可以变成半透膜，如鱼死亡后，鱼鳔可用于渗透原理实验。
选择透过性膜是活细胞内的生物膜，主要由其中的载体决定物质是否能够通过。这种特性使生物膜起到了半透膜的作用，但不属于半透膜。学生易把选择透过性膜等同于半透膜。
3脂肪与脂质
脂肪指由甘油和脂肪酸组成的三酰甘油酯，属于脂质中的一类。脂肪是细胞内良好的储能物质，其化学组成元素是C、H、O。而脂质指脂肪酸和醇作用生成的酯及其衍生物，常见的有脂肪、磷脂和固醇等，其化学组成元素主要是C、H、O。学生易混淆的主要原因是不清楚二者的关系。
4提取液与层析液
叶绿体色素的提取和分离试验中，提取色素时，常用无水乙醇等有机溶剂作提取液，提取色素。利用的原理是叶绿体中色素易溶于有机溶剂不溶于水。色素的分离用的是层析液，其原理是不同色素在层析液中溶解度不同，从而将色素分离开来。提取液与层析液在本实验中使用的目的和实验阶段是不同的。
5中心体与中心粒
中心体是动物和一些低等植物细胞中的一种没有膜结构的、由蛋白质形成的细胞器，由两个相互垂直的中心粒及其周围物质构成。与细胞的有丝分裂有关，参与形成纺锤体。而中心粒只是中心体的组成结构的一部分，不是细胞器。学生看到有的地方写成中心体，有的地方写成中心粒，就误认为这是同一种结构。
6姐妹染色单体与染色单体
细胞分裂过程中，染色体复制后，一个着丝点上连着的两条DNA分子（及其上面的蛋白质等）就叫两条姐妹染色单体。在有丝分裂后期或减数第二次分裂后期，随着着丝点一分为二，一个着丝点上的两条姐妹染色单体分开，形成两条新的染色体。
减数分裂中，同源染色体联会形成四分体。四分体中的两条染色体分别含有两条姐妹染色单体，故称含有四条染色单体，叫做四分体。这四条染色单体中，既有姐妹染色单体，还有非姐妹染色单体。所以不能说一个四分体中含有四条姐妹染色单体。学生常理解为四分体中含有4条姐妹染色单体。
7龙胆紫与龙胆紫溶液（染液）
龙胆紫（俗称紫药水）是氯化四甲基副玫瑰苯胺、氯化五甲基副玫瑰苯胺和氯化六甲基副玫瑰苯胺的混合物。
观察植物根尖分生组织细胞有丝分裂实验中对染色体染色用的是质量浓度0.01g/mL或0.02g/mL的龙胆紫溶液。
染料是能使纤维和其他材料着色的物质。而上述实验中对染色体染色的是配置成的特定的溶液。所以不能说用龙胆紫染料对染色体染色。与之类似的还有醋酸洋红、醋酸洋红溶液及醋酸洋红染料的区别。学生答题时经常写成用“龙胆紫”对染色体进行染色。
8基因突变与突变
基因突变指DNA分子中发生碱基对的增添、缺失或替换而引起的基因结构的改变，又称为点突变。它是可遗传变异中的一种类型。
教材中生物进化内容里面，突变包括基因突变和染色体变异两方面，它是生物进化重要的原材料。在遗传学中，基因突变属于狭义的突变，进化内容中的突变属于广义的突变。学生回答“什么为进化提供了原材料”时常错误答成“基因突变和基因重组”。
9生长激素与生长素
生长激素是由动物垂体产生的一种多肽类动物激素；而生长素是植物体内产生的一种激素，化学本质是吲哚乙酸，是一种有机酸。二者虽然分别对动植物有促进生长发育的作用，但其来源、产生部位、化学本质等方面都不同。学生常见错误是将动物产生的“生长激素”错误写成“生长素”。
10细胞液与细胞内液
细胞液是成熟植物细胞的液泡中的液体，调节植物细胞内的环境，使植物坚挺。细胞内液指存在于细胞内的所有液体，属于体液的范畴。学生将二者混淆主要原因是对二者的含义没弄清楚。
11二苯胺与二苯胺试剂
二苯胺是一种白色至浅灰色的晶体物质，有毒。
选修一中鉴定DNA分子用的二苯胺试剂，课本中的配制如下：1.5g二苯胺溶于100mL冰醋酸中，再加1.5mL浓硫酸，用棕色瓶保存；临用前，在10mL的上述溶液中加入0.1mL体积分数为0.2%的乙醛溶液。溶液一般指物质的水溶液，很明显二苯胺试剂是一种较复杂的溶液，不仅仅是二苯胺的水溶液。DNA分子鉴定的显色是化学反应的结果，而染液染色原理是有色染料物质附着于物体上使其显示出染料的颜色来，所以本鉴定试验中颜色的出现与染料染色原理不同，不能说是二苯胺染液。学生答题时常将“二苯胺试剂”中的“试剂”二字漏掉。
12双缩脲与双缩脲试剂
双缩脲指两分子的尿素反应生成的分子，在碱性条件下能于Cu2+发生紫色反应。双缩脲试剂是鉴定样品中是否有蛋白质而用的专门的试剂（由A液：浓度为0.1g/mL的NaOH溶液和B液：浓度为0.01g/mL的CuSO4溶液组成。）。蛋白质鉴定时，依次向样品中加入A液和B液，摇匀观察颜色变化，如果出现紫色，说明样品中含蛋白质。学生往往答题时写成用“双缩脲”检测蛋白质，没搞清楚二者的实质。13胚胎与胚胎时期
胚胎是指受精卵经过多次细胞分裂和细胞分化后形成的有发育成生物成体能力的雏体，指有性繁殖发展形成过程的最初阶段，物质实体。
胚胎时期是指从受精卵到胎儿出生的时期，指的是一段时间。在做填空题时，有些学生老是填成“人体细胞分化的最大限度是胚胎”，将实体结构与时间名词混淆。
14自交与自由交配
自交是指来自同一个体的雌雄配子的结合或具有相同基因型个体间的交配。
自由交配也叫随机交配，指种群内各基因型个体之间均可进行交配，包括相同基因型个体间，不同基因型个体间的随机配对交配。而有的自由交配（像自然状态下的豌豆）实质上还是分别自交，所以在答题时应注意亲本能否自由交配。在已知亲本，计算子代基因型频率时，前者只需分别统计各自自交结果，然后相加就行，而后者往往要利用基因平衡定律（如果适合）计算子代的基因型频率。学生往往容易将两个名词意思理解错误，导致解错题。
15基因重组与基因自由组合
广义的基因重组指任何造成基因型变化的基因交流过程，狭义的仅指DNA分子内断裂和连接而产生DNA片段的交换和重新组合。基因重组在真核生物和原核生物中都可以发生，真核生物减数分裂四分体时期同源染色体中的非姐妹染色单体之间的交叉互换、减数第一次分裂后期非同源染色体间的自由组合，原核生物中的转化、转导、结合过程等都涉及基因重组。高中课本中的基因工程原理、格里菲斯及艾弗里的体内体外转化实验的实质都是基因重组。
基因的自由组合指真核生物减数分裂中，减数第一次分裂后期同源染色体分离的同时，非同源染色体上的非等位基因的自由组合过程。这是孟德尔遗传定律中自由组合定律的实质。是属于基因重组中的一个方面。有些学生答题时因不清楚二者的范围和具体指代而答错。
16起始密码子与启动子、终止密码子与终止子
起始密码子和终止密码子都在mRNA分子上，在翻译过程中起作用，起始密码子是AUG和GUG，终止密码子有三种，分别是UAA、UAG和UGA。启动子是基因5’端上游的一段DNA序列，是转录时RNA聚合酶的结合位点，是开启基因转录的。终止子是位于基因尾端的一段DNA序列，在转录时起转录终止信号的作用。此处两类密码子与启动子终止子在部位、起作用时间和作用方面都不相同。学生混淆这几个名词的很可能的原因是对其实质未理解清楚
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