真菌有单细胞的个体，也有多细胞的个体。真菌的细胞都有细胞壁、细胞膜、细胞质和细胞核。多细胞的真菌由细胞形成菌丝。有些菌丝位于营养物质的上面，称为直立菌丝；有些菌丝深入到营养物质内部，称为营养菌丝。
细菌和真菌的比较：
| 项目 | 形态特点 | 结构特点 | 生殖方式 | 营养方式 | 菌落 |
| 细菌 | 个体十分微小，宽度 (或直径)约0．5～ 1微米；形状有球状、杆状、螺旋状等 | 都是单细胞个体，细胞具有细胞壁、细胞膜、细胞质等，没有成形的细胞核，属于原核生物。有的有荚膜、鞭毛．有的可以形成芽孢 | 分裂生殖 (裂殖) | 多数异养，少数自养 | 较小，表面光滑黏稠或粗糙干燥 |
| 真菌 | 个体大小差别较大，有十分微小的单细胞个体，也有大型的多细胞个体；多数为由菌丝构成的菌丝体 | 少数为单细胞个体，多数为多细胞个体，细胞有细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核，细胞内有真正的细胞核，属于真核生物，菌丝一般有隔膜 | 孢子生殖，有的还进行出芽生殖(酵母菌) | 异养(寄生或腐生) | 较大，霉菌的菌落常呈绒毛状、絮状、蜘蛛网状，有时呈现黄、褐、红、绿、黑等颜色 |
相关初中生物知识点：真菌的种类
真菌的种类：
分为酵母菌、霉菌和蕈菌（大型真菌），比如木耳、牛肝菌、香菇、灵芝等。
酵母菌、霉菌和蕈菌（大型真菌）的比较：
| 真菌 | ||||
 |  |  | ||
| 不同点 | 形态 | 微小 | 较大 | 大型 |
| 结构 | 有一个大液泡，单细胞生物 | 无大液泡，菌丝连接，多细胞生物 | ||
| 生殖方式 | 主要是出芽生殖，环境恶劣时进行孢子生殖 | 孢子生殖 | ||
| 相同点 | 结构 | 细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核 | ||
| 营养方式 | 异养，腐生 | |||
青霉和曲霉的比较：
| 项目 | 青霉 | 曲霉 |
| 不同点 | 直立菌丝顶端着生孢子的结构呈扫帚状，孢子一般呈青绿色 | 直立菌丝顶端着生孢子的结构呈放射状．孢子随种类不同呈现黄色、褐色、绿色、橙红色或黑色等 |
| 相同点 | 多细胞连接形成的菌丝构成，细胞都有细胞壁、细胞膜、细胞质、细胞核，营异养腐生，都能产生孢子，靠孢子繁殖 | |
易错点：
误认为细菌和真菌都是有害的
人们常常“谈菌色变”，其实在自然界中，大多数的菌类对人类是有益的，只有少数是有害的。例如，苏云金杆菌、白僵菌可以杀死许多害虫；醋酸菌可用于制醋；乳酸菌可以制泡菜、酸牛奶；制甲烷离不开甲烷菌；根瘤菌可使豆科植物生长良好；有些真菌如各种蘑菇、木耳等大型真菌可以食用。可见，并不是所有的细菌和真菌都是有害的。
相关初中生物知识点：真菌的繁殖
真菌的生殖：
真菌是通过产生大量的孢子来繁殖后代的，霉菌的直立菌丝顶端生有孢子，蘑菇的菌褶处也生有孢子，孢子随风飘散，在适宜的环境条件下，能发育成一个新个体。单细胞的酵母菌还可进行出芽生殖。孢子生殖和出芽生殖都是无性生殖。
相关初中生物知识点：真菌的生活方式及营养方式
真菌的营养：
真菌的细胞内没有叶绿体，只能靠获取现成的有机物生活，为异养生物，又可分为寄生和腐生两种方式。
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