北大邓兴旺PLOS发表研究新成果

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12月29日,来自北京大学、瑞典哥特堡大学、斯里兰卡科伦坡大学、瑞典乌普萨拉大学和美国耶鲁大学的研究人员,在国际著名遗传学期刊《PLOSGenetics》发表题为“ArabidopsisCOP1SUPPRESSOR2RepressesCOP1E3UbiquitinLigaseActivitythroughTheirCoiled-CoilDomainsAssociation”的学术成果。在这项研究中,研究人员通过正向遗传筛选确定了一个新的COP1抑制因子??CSU2。北京大学生命科学学院的邓兴旺教授和耶鲁大学的NingWei是本文共同通讯作者。

阳光不仅提供了主要的能量来源,而且也是一个重要的环境信号,调节着植物的多个发育过程,如种子萌发、光形态建成、开花、向光性和根系生长。在拟南芥(Arabidopsisthaliana)中,光敏色素(phyA-phyE)能感知红光和远红光(600?750nm);隐花色素(CRY1和CRY2)和向光素(PHOT1和PHOT2)能感知蓝光和紫外线(315?500nm);UVR8作为UV-B(~280nm)的光感受器。

为了响应光照,光感受器能直接作用于整个基因组的许多个基因启动子,以调控它们靶基因的表达,使植物能够迅速适应不断变化的光环境。在没有光照的情况下,植物会长出长的下胚轴、根尖沟、未开放的子叶和etioplastids,一种独特的发育程序,被称为暗或黄化。在光照下,植物经历了光形态建成,其特点是短下胚轴、延伸的子叶和成熟的叶绿体。这个程序对于陆生植物是非常重要的,因为它们的生命往往开始于黑暗的土壤中。该程序使植物准备好暴露于阳光下(这一过程称为绿化),而在黑暗中的无力枯黄,在光照射时则是致命的损伤。

CONSTITUTIVELYPHOTOMORPHOGENIC1(COP1)基因,作为光形态建成的抑制因子,对于黄化是必不可少的,其功能缺失突变体在黑暗中表现出一种组成型光形态表型。COP1蛋白含有一个RING指,一段卷曲螺旋结构域,和WD-40重复结构域,它的功能是作为一个E3泛素连接酶,靶定一小部分光敏形态发生促进因子,用于泛素化和降解。

在植物细胞中,COP1作为同型二聚体而存在,这进一步稳定了两个SPA蛋白之间的联系,从而形成一个四聚体蛋白复合物。COP1二聚化及其与SPA蛋白之间的相互作用,是通过各自蛋白的卷曲螺旋结构域介导的。与SPA蛋白的联系,提高了COP1靶定底物泛素化的活性。

在幼苗中,COP1的底物包括LONGHYPOCOTYL(HY5)、HY5HOMOLOG(HYH)、LONGHYPOCOTYLINFAR-RED1(HFR1)、LONGAFTERFAR-REDLIGHT1(LAF1)、SALTTOLERANCEHOMOLOG3(STH3/BBX22)和PHYTOCHROMEINTERACTINGFACTOR3-LIKE1(PIL1)。除了幼苗光形态建成,COP1也介导CONSTANS(CO)、GIGANTEA(GI)、EARLYFLOWERING3(ELF3)、HYPERSENSITIVERESPONSETOTCV(HRT)、SCAR1、GATATRANSCRIPTIONFACTOR2(GATA2)和MYC2的降解,并在各个发育过程(包括花期、生物钟、病毒防御、根系发育、激素信号转导和调控miRNA的生物合成)中发挥着至关重要的作用。从植物到动物,COP1在进化上都是保守的。哺乳动物COP1已被报道为一个肿瘤抑制基因,可通过它的E3泛素连接酶活性,靶定癌蛋白c-Jun和ETS。

作为一个关键的调控因子,COP1蛋白的水平、活动和定位,是受到严格控制的,以确保其靶标的适当蛋白质积累,响应发育和环境线索。在黑暗中,COP1富集在细胞核中,在那里它靶定底物用于泛素化。光照可触发光感受器,包括phyA、phyB、CRY1和CRY2,以与SPA蛋白或COP1联系在一起,从而抑制了COP1-SPAE3泛素连接酶的活性。这一事件之后紧接着是COP1从细胞核到细胞质的重新分配。此外,最近的研究表明,CSU1、SPAs和PIFs有助于COP1蛋白水平和活性的调节。

为了寻找调控COP1功能或介导其产量的新因素,研究人员对cop1-6(cop1突变体的亚效等位基因)的抑制因子,进行了遗传筛选。之前这种筛选已经成功地鉴定了CSU1??可靶定COP1的一种E3泛素连接酶。

在这项研究中,研究人员报道了一个新的COP1抑制因子,指定为CSU2。在黑暗中,CSU2突变几乎完全抑制了cop1-6的组成型光形态表型。CSU2可通过一种卷曲螺旋域联系,与核小点中的COP1相互作用并共同定位。CSU2能够抑制COP1E3泛素连接酶的活性。此外,CSU2在根部发育过程中发挥重要的作用。总的来说,这项研究的遗传和生化数据表明,拟南芥CSU2作为COP1的一个负调控因子,有助于优化植物的发育。


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