巴西转基因作物的采用率逐渐增加，成为世界第二大使用这种技术的国家，仅次于美国。根据国际农业生物技术应用服务组织（ISAAA）的统计，/15年度巴西种植的大豆作物91.9％为转基因品种，上两个种植季则为87％。转基因大豆采用率最高的地区是巴西南部，占比超过95％。在巴西北部较新的生产地区，约80％为转基因大豆品种。

马托格罗索州是巴西最大的大豆生产州，但只有85.9％的大豆作物为转基因。基于传统大豆市场所提供的额外收益，该州西部的农民大多仍种植常规的大豆品种（非转基因）。对于这个区域的农民，保留常规的大豆的特性也更加容易，因为几乎所有的大豆均从沿亚马逊河的限制数量的港口进行出口。

/15年巴西种植的玉米作物中预计有88.8％为转基因品种，/14和/13年度分别为86％和80％。中西部地区和巴西南部的农民更倾向于使用转基因玉米杂交种，这一新技术作物的采用率略高于90％。巴西北部对这些品种的采用率滞后，仅约60％。

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